あれから3年――。ロバート・ラングドン教授（トム・ハンクス）は、歴史上最も謎に包まれた秘密結社“イルミナティ”の復活の証拠を発見し、彼らが最大の敵とみなす“カトリック教会＝ヴァチカン”に致命的な脅威が迫っていることを知る。イルミナティの計画が密か…